More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2167 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 437 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  68.89 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  70.05 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  68.42 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  57.18 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  52.73 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  53.88 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  55.33 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  52.91 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  52.66 
 
 		 427 aa  362  9e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  39.55 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  40.34 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.01 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  38.77 
 
 		 450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  38.77 
 
 		 449 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  38.77 
 
 		 449 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  38.77 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.77 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.77 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.77 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  38.54 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  37.83 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  39.19 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  38.58 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  38.85 
 
 		 505 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  38.39 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  39.49 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  43.96 
 
 		 422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  38.67 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  33.53 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  31.74 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  36.88 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 475 aa  173  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  30.67 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.64 
 
 		 291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  29.97 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  34.19 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.36 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 842 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.34 
 
 		 806 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  35.07 
 
 		 782 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 637 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  33.44 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 843 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 843 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  32.9 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 636 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 844 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 859 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  36.91 
 
 		 832 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  27.82 
 
 		 441 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.27 
 
 		 1144 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 830 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.65 
 
 		 825 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.89 
 
 		 1115 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 845 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  34.96 
 
 		 1120 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  34.96 
 
 		 1120 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  34.96 
 
 		 1120 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1108 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1108 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1108 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1108 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1108 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 1235 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 861 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1103 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 860 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1107 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  34.08 
 
 		 1158 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 840 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>