More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2739 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 457 aa  919    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  79.46 
 
 		 456 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  66.45 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  66.44 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  67.33 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  50.6 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  50.12 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  50.6 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.53 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  49.3 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  49.88 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  49.88 
 
 		 449 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.3 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.3 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.3 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  48.83 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  49.88 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  50.23 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  49.54 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  49.88 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  49.64 
 
 		 505 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  49.64 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  49.4 
 
 		 461 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  44.31 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 444 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  37.07 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  38.52 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  39.57 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  39.23 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  37.63 
 
 		 322 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  34.13 
 
 		 439 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  35.15 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  34.14 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  31.59 
 
 		 479 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  36.39 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  38.26 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  35.67 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 806 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.61 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.41 
 
 		 1144 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  33.9 
 
 		 448 aa  156  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 637 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 832 aa  149  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 842 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.7 
 
 		 825 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 840 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  32.25 
 
 		 441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 1235 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  29.9 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 845 aa  140  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  38.02 
 
 		 1115 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  32.4 
 
 		 1133 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1107 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 636 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 859 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  33.22 
 
 		 1166 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1115 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 1127 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 877 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 636 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  33.59 
 
 		 1111 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1107 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 752 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1118 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1118 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1120 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 843 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1120 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1118 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1107 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  29.43 
 
 		 825 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 287 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1103 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  35.55 
 
 		 1098 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 		 685 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1107 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>