169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2896 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
397 aa  798    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 
403 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.41 
 
 
389 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.28 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.2 
 
 
405 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.46 
 
 
403 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.88 
 
 
403 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.7 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  27.05 
 
 
419 aa  133  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  28.86 
 
 
334 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.33 
 
 
357 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.11 
 
 
351 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  27.95 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.14 
 
 
360 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  30.6 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.16 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  25.87 
 
 
341 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  24.85 
 
 
419 aa  116  6e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.82 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.14 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  28.53 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.47 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.58 
 
 
359 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.2 
 
 
352 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.97 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.68 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  30.38 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.72 
 
 
350 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 
353 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.95 
 
 
334 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.86 
 
 
360 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.7 
 
 
353 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.74 
 
 
451 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  26.84 
 
 
418 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  31.36 
 
 
348 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.77 
 
 
357 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  28.28 
 
 
354 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  28.47 
 
 
338 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  29.58 
 
 
342 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.5 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  29.25 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
459 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.52 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  27.02 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  28.72 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  31.09 
 
 
379 aa  94  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.89 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  33.93 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.68 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.99 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  32.74 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 
351 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  27.72 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  32.63 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  28.07 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  27.84 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  32.63 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  26.29 
 
 
359 aa  53.5  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  28.86 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  29.41 
 
 
594 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  31.41 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  28.9 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  27.44 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  31.72 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  35.9 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  35.77 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  31.95 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  31.88 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  26.47 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  27.47 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  26.87 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  27.59 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  30.41 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  29.61 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  27.27 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  36.97 
 
 
368 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  29.57 
 
 
370 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  34.31 
 
 
368 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  30.48 
 
 
382 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 
356 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  26.82 
 
 
364 aa  47  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  26.82 
 
 
364 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  33.85 
 
 
365 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  28.02 
 
 
361 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  26.74 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  26.74 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  34.19 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  24.66 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  25.86 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  26.74 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  26.74 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  32.16 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  39.22 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>