181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1469 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
334 aa  667    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  91.02 
 
 
334 aa  614  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  93.41 
 
 
334 aa  573  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  75.75 
 
 
334 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  58.84 
 
 
341 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 
342 aa  226  4e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.94 
 
 
354 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.47 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  36.34 
 
 
353 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 
342 aa  218  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
357 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.06 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.72 
 
 
356 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  36.06 
 
 
353 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.39 
 
 
359 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 
354 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.79 
 
 
352 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.06 
 
 
359 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.76 
 
 
350 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 
359 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  35.05 
 
 
351 aa  189  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.82 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  34.44 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.94 
 
 
360 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.05 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  38.83 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.81 
 
 
356 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.83 
 
 
355 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.19 
 
 
352 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  32.46 
 
 
352 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  31.03 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.21 
 
 
405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  32.21 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  32.3 
 
 
355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  27.95 
 
 
397 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  32.32 
 
 
353 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.86 
 
 
357 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.17 
 
 
349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  33.48 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.07 
 
 
399 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  28.57 
 
 
403 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  33.8 
 
 
349 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.67 
 
 
403 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.5 
 
 
389 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.78 
 
 
403 aa  96.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.28 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  29.81 
 
 
419 aa  92  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.38 
 
 
454 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  28.71 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  27.85 
 
 
418 aa  79.3  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  25.26 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  24.81 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  24.81 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  22.39 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.79 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  27.27 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  26.89 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.76 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.93 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.11 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  26.23 
 
 
360 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  21.36 
 
 
451 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  23.79 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  23.05 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.97 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  23.05 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  24 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  23.85 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  23.05 
 
 
367 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  23.05 
 
 
367 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  23.05 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  23.05 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  24.18 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  26.07 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  25.44 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.69 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  25.69 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  23.08 
 
 
367 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  21.97 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.92 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  28 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  21.57 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>