183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1729 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
354 aa  723    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.14 
 
 
351 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.81 
 
 
354 aa  280  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.32 
 
 
357 aa  278  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.98 
 
 
359 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.17 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.69 
 
 
360 aa  269  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
351 aa  260  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.75 
 
 
360 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.12 
 
 
359 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  38.51 
 
 
351 aa  249  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.86 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 
342 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  39.34 
 
 
342 aa  236  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.78 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.23 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 
342 aa  233  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 
347 aa  227  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.54 
 
 
352 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 
338 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  36.93 
 
 
353 aa  222  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  37.22 
 
 
353 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
350 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  40.88 
 
 
341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.35 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  31.2 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.07 
 
 
355 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.97 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  30.47 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.72 
 
 
352 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.11 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.22 
 
 
334 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  33.45 
 
 
355 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  40.08 
 
 
334 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  30.06 
 
 
353 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  33.09 
 
 
349 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.64 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  27.27 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  32.37 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  27.11 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  25.14 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.35 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.34 
 
 
399 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.28 
 
 
405 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  28.28 
 
 
397 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  27.75 
 
 
419 aa  95.9  9e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.28 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.95 
 
 
403 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 
366 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  24.22 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.84 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  26.84 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  27.66 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  27.31 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.24 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  26.94 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  27.4 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  26.38 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  26.42 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  27.65 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  27.65 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  27.05 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  27.65 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  27.05 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  27.65 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  25.53 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.61 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.83 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  24.77 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  29.07 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  24.16 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  24.74 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  25.66 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  25.36 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  23.91 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.6 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  26.81 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  24.76 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  27.73 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.77 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  25.89 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  30.77 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  24.07 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>