179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1971 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  100 
 
 
358 aa  726    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  49.86 
 
 
338 aa  334  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  49.72 
 
 
342 aa  332  7.000000000000001e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 
342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  47.29 
 
 
342 aa  325  7e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.99 
 
 
354 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.68 
 
 
359 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.59 
 
 
357 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.65 
 
 
359 aa  238  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.04 
 
 
351 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  35.23 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.72 
 
 
360 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
356 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 
351 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.39 
 
 
359 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  37.33 
 
 
351 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.16 
 
 
341 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.55 
 
 
352 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.81 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  36.75 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  38.7 
 
 
353 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.91 
 
 
352 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  37.85 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  35.73 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.04 
 
 
334 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.47 
 
 
350 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.61 
 
 
334 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.26 
 
 
334 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.95 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.32 
 
 
356 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  33.07 
 
 
348 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  29.25 
 
 
403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.68 
 
 
349 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  30.58 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.68 
 
 
389 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  28.97 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.68 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  29.84 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  31.37 
 
 
351 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.82 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  27.68 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  28.13 
 
 
356 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32 
 
 
399 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  29.82 
 
 
349 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.77 
 
 
405 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  27.67 
 
 
355 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  29.11 
 
 
419 aa  99.4  8e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  26.63 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  26.18 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.56 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.01 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.63 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.27 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  26.99 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  27.1 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  27.1 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  25.88 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  28.86 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.39 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.85 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  23.87 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.15 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  24.53 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.43 
 
 
423 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  26.38 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.14 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  27.07 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.3 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.6 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.83 
 
 
454 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  25.98 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  27.16 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  25 
 
 
361 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
385 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.9 
 
 
364 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  28.74 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.73 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  23.11 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  28.16 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  28.16 
 
 
362 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  28.16 
 
 
362 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
367 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  26.95 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  26.23 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  24.1 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  22.68 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  23.64 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  33.01 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  23.38 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>