223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1827 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
342 aa  690    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  76.54 
 
 
342 aa  553  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  73.98 
 
 
342 aa  530  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  70.18 
 
 
338 aa  511  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  49.72 
 
 
358 aa  332  7.000000000000001e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  45.14 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  44.01 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.38 
 
 
357 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  45.37 
 
 
351 aa  248  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.25 
 
 
359 aa  247  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.69 
 
 
356 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  38.86 
 
 
354 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.59 
 
 
359 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40 
 
 
359 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.3 
 
 
360 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40 
 
 
352 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 
351 aa  222  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  39.49 
 
 
334 aa  222  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.15 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.01 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.89 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 
347 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.93 
 
 
334 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  38 
 
 
353 aa  205  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.73 
 
 
350 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.64 
 
 
334 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.32 
 
 
334 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.8 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  32.93 
 
 
352 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.22 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.56 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  35.41 
 
 
349 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  28.21 
 
 
353 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.16 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  29.67 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  34.77 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  34.39 
 
 
351 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.27 
 
 
349 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  28.7 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  28.18 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.03 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  28.86 
 
 
356 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.95 
 
 
405 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  34.63 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.67 
 
 
399 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
366 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  27.02 
 
 
397 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  31.03 
 
 
419 aa  93.2  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.93 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  28.02 
 
 
364 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  28.02 
 
 
364 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.9 
 
 
403 aa  89.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  28.05 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  28.76 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  26.76 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  26.61 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  26.61 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  29.11 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  26.2 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  25.63 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  27.27 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.22 
 
 
454 aa  75.9  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  26.06 
 
 
367 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  26.06 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  31.56 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  26.06 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  26.06 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  27.2 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  26.06 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.47 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  27.24 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  27.9 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  24.27 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  27.02 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  26.41 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  26.16 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  24.13 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  25.23 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>