224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2486 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
353 aa  723    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.27 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  37.1 
 
 
348 aa  228  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 
349 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.02 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.71 
 
 
357 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  30.06 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.83 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  33.11 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  31.69 
 
 
352 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.13 
 
 
354 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.61 
 
 
356 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  30.82 
 
 
351 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
355 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 
342 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  30 
 
 
338 aa  156  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.45 
 
 
341 aa  155  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.08 
 
 
352 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  34.35 
 
 
334 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  31.42 
 
 
342 aa  149  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.85 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  28.69 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
359 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.82 
 
 
360 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  29.49 
 
 
351 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.58 
 
 
352 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.08 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  30.24 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.09 
 
 
405 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  32.65 
 
 
353 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  32.26 
 
 
349 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  32.24 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.66 
 
 
334 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.08 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  24.79 
 
 
403 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.43 
 
 
403 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.27 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  28.32 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.87 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.98 
 
 
403 aa  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  29.95 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.2 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.2 
 
 
389 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  28.02 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  29.8 
 
 
418 aa  103  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  30.85 
 
 
459 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.73 
 
 
423 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.71 
 
 
454 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  26.95 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.67 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  24.64 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  27.54 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  34.62 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  24.84 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  24.84 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  21.56 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  27.8 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.38 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  22.07 
 
 
383 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  27.27 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.67 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.97 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.41 
 
 
380 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  29.61 
 
 
398 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.13 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  24.36 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  23.63 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 
396 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  27.81 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  28.32 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  30.54 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  29.94 
 
 
371 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 
373 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 
373 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  29.94 
 
 
371 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  29.94 
 
 
371 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  30.53 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  21.75 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  28.36 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  28.36 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  31.96 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>