172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4107 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
357 aa  716    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  65.73 
 
 
352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  66.29 
 
 
352 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  64.61 
 
 
355 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  63.04 
 
 
349 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  59.27 
 
 
355 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  58.64 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  53.53 
 
 
351 aa  338  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.13 
 
 
359 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  33.43 
 
 
356 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.8 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  30.11 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.71 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.3 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.03 
 
 
356 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  34.78 
 
 
351 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.94 
 
 
354 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  38.35 
 
 
347 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.64 
 
 
357 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  35.41 
 
 
351 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
352 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.32 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  35.16 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.42 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.58 
 
 
352 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  29.51 
 
 
353 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  32.58 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  30.73 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.15 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  32.24 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  30.41 
 
 
353 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  29.57 
 
 
342 aa  123  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  32.42 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 
349 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  28.18 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.82 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.86 
 
 
334 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  28.77 
 
 
397 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.73 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.32 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  31.16 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.39 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.39 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.74 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.9 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.17 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.17 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  29.5 
 
 
419 aa  84  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  24.1 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  26.97 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.54 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  28.08 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  28.22 
 
 
459 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.78 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.18 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.66 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.42 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.42 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  26.51 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  28.1 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  28.08 
 
 
365 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.09 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  19.41 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  28.28 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  28.28 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  27.05 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  30.46 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  27.61 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.9 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
364 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  26.96 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  35.16 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
383 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 
385 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  24.6 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  26.95 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  34.69 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  35.56 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>