183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0711 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
342 aa  676    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  77.71 
 
 
342 aa  555  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  73.98 
 
 
342 aa  530  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  72.51 
 
 
338 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  49.58 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  43.42 
 
 
351 aa  257  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.98 
 
 
356 aa  252  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  44.61 
 
 
354 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.5 
 
 
357 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  43.45 
 
 
359 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.06 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.03 
 
 
359 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 
351 aa  242  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.94 
 
 
360 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 
354 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  38.75 
 
 
334 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.73 
 
 
352 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.52 
 
 
360 aa  223  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  39.07 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.46 
 
 
352 aa  219  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 
353 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.46 
 
 
334 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.31 
 
 
341 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  39.36 
 
 
353 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  37.12 
 
 
347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.05 
 
 
350 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.89 
 
 
334 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  41.25 
 
 
334 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.76 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  32.43 
 
 
351 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  31.03 
 
 
352 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.16 
 
 
356 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30 
 
 
352 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  28.61 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  33.61 
 
 
348 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.57 
 
 
357 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.47 
 
 
349 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  30.92 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  30.9 
 
 
403 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  35.64 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  35.86 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.6 
 
 
389 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  34.83 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.13 
 
 
405 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.83 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  28.72 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.66 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.06 
 
 
399 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  31.84 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  26.42 
 
 
365 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  29.79 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  29.79 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.65 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  30.71 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  26.35 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.63 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  26.35 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  26.35 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  31.28 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  28.11 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  26.06 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  28.63 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  29.37 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  29.37 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  29.37 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  29.37 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  29.37 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  26.91 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  30.92 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  29.54 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  25.56 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  29.39 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  27.96 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  32.04 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  31.03 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  27.8 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  29.11 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  31.03 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  31.03 
 
 
371 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  28.63 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  27.85 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>