229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1816 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
351 aa  706    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  65.24 
 
 
351 aa  477  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.4 
 
 
356 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  44.6 
 
 
357 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  40.69 
 
 
351 aa  267  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
354 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  46.11 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.51 
 
 
354 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.88 
 
 
360 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 
342 aa  249  6e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  45.37 
 
 
342 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.41 
 
 
352 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.94 
 
 
360 aa  247  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.36 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.36 
 
 
359 aa  243  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  42.54 
 
 
342 aa  242  7e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
359 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.77 
 
 
352 aa  239  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  39.44 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  39.83 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.44 
 
 
358 aa  227  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.83 
 
 
350 aa  226  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  36.83 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  42.01 
 
 
341 aa  192  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  34.73 
 
 
334 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.1 
 
 
355 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.23 
 
 
356 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  32.7 
 
 
351 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  32.81 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.78 
 
 
357 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.65 
 
 
352 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
349 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.54 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  30.82 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  35.02 
 
 
348 aa  136  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.74 
 
 
349 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.21 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  29.37 
 
 
403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.49 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  38.46 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.29 
 
 
389 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.21 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  32.2 
 
 
356 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.38 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  30.6 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.54 
 
 
403 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  34.23 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.02 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  33.18 
 
 
419 aa  102  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  35.2 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  33.8 
 
 
418 aa  87.4  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.24 
 
 
454 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.13 
 
 
423 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.2 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  29.06 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  23.84 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  28.81 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  21.32 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  25.74 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.47 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  27.02 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  24.13 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  24.51 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  25.1 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  25.1 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  22.74 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.19 
 
 
364 aa  63.2  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.43 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.19 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  26.67 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  21.93 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.34 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  27.16 
 
 
359 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  23.66 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  27.21 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  22.22 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  23.81 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  24.92 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.46 
 
 
383 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  23.34 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  33.98 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  23.34 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  24.31 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  21.91 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
377 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.58 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.71 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.08 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  23.03 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  26.23 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  21.64 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  26.23 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  26.23 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  26.23 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>