More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  100 
 
 		 383 aa  757    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  70 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  64.23 
 
 		 395 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.53 
 
 		 385 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  50.41 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  50.41 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  50.41 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  50.14 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  49.59 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  49.86 
 
 		 367 aa  348  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.29 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  49.86 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  49.43 
 
 		 360 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  49.72 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.56 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  48 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  48.18 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  50.14 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 		 368 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  44.54 
 
 		 365 aa  305  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.1 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.35 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  41.85 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 		 374 aa  288  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  46.01 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  39.94 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  45.73 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  45.73 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  45.45 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  42.3 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  43.38 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  43.1 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  43.1 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  43.1 
 
 		 371 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  42.25 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  42.07 
 
 		 374 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  37.4 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  37.67 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  36.14 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  34.62 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  34.5 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 378 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  32.49 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  31.73 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  34.84 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  34.84 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  34.84 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  28.29 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  27.45 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  27.07 
 
 		 372 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  24.72 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  28.07 
 
 		 362 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  28.34 
 
 		 362 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  28.45 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  28.07 
 
 		 362 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  27.99 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  28.84 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  28.07 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  28.84 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  27.52 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  27.52 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  28.84 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  27.47 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  28.84 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  31.45 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  32.89 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  26.54 
 
 		 359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1934  hypothetical protein  32.14 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>