200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1239 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  100 
 
 
334 aa  662    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  79.04 
 
 
334 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  75.75 
 
 
334 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  78.14 
 
 
334 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  59.94 
 
 
341 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
342 aa  224  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.9 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  37.32 
 
 
342 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
357 aa  215  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  40.86 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.6 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  35.03 
 
 
353 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  37.29 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.42 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.47 
 
 
358 aa  200  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.73 
 
 
352 aa  199  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  37.16 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.11 
 
 
359 aa  196  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.94 
 
 
359 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.76 
 
 
350 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.25 
 
 
360 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  34.18 
 
 
353 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.13 
 
 
359 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.98 
 
 
360 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.93 
 
 
351 aa  183  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  33.03 
 
 
347 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  36.49 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.69 
 
 
355 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.85 
 
 
356 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.7 
 
 
352 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  35.29 
 
 
352 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
349 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  32.62 
 
 
355 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  31.52 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  34.72 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.79 
 
 
405 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.65 
 
 
349 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.4 
 
 
357 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  28.72 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  35.11 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  34.29 
 
 
349 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.69 
 
 
399 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  26.46 
 
 
403 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  29.1 
 
 
356 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.67 
 
 
403 aa  99.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.34 
 
 
389 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.33 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  30.69 
 
 
419 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.1 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  28.38 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.22 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  28.71 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  29.48 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  29.48 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  25.54 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  27.14 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  22.12 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  38.89 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  26.02 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  25.72 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  24.19 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  26.42 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.69 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.64 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.19 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  25.71 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  22.39 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  21.76 
 
 
366 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.38 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  22.67 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  25.3 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  23.65 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  34.83 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.31 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  26.84 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  22.45 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  24.31 
 
 
396 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  23.3 
 
 
451 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.53 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  24.29 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  24.08 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  32 
 
 
376 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.45 
 
 
385 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>