91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0627 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  94.54 
 
 
403 aa  779    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
403 aa  820    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.83 
 
 
399 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  28.8 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.21 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  27.88 
 
 
419 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  28.61 
 
 
418 aa  139  7e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  36.28 
 
 
403 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.27 
 
 
405 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36 
 
 
423 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.88 
 
 
360 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.14 
 
 
454 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  34.02 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.13 
 
 
357 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.53 
 
 
359 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 
351 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.81 
 
 
349 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  32.09 
 
 
353 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.33 
 
 
359 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  30.66 
 
 
347 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.65 
 
 
341 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
360 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.41 
 
 
356 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.29 
 
 
352 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  34.29 
 
 
352 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  32.86 
 
 
379 aa  101  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  32.41 
 
 
351 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  30.19 
 
 
348 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  29.78 
 
 
334 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  32.83 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.6 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  32.83 
 
 
342 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  29.31 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  32.66 
 
 
338 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  24.22 
 
 
451 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.72 
 
 
356 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.57 
 
 
354 aa  94  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  31.19 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.39 
 
 
357 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30 
 
 
352 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.34 
 
 
355 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  30.93 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.56 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  30.28 
 
 
353 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  29.95 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  26.25 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  31.67 
 
 
349 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.53 
 
 
350 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.84 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.78 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  28.43 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  28.95 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.22 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.28 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  34.58 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0161  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.64 
 
 
311 aa  57.4  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000741959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  26.06 
 
 
321 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  28.43 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  28.15 
 
 
360 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.97 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  29.38 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  29.38 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.11 
 
 
373 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.76 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  33.7 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.55 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  27.45 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  25.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  28.69 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0208  3-dehydroquinate synthase  32.95 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0205078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  23.64 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  26.88 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  28.46 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  28.46 
 
 
362 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  28.46 
 
 
362 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
362 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  30.82 
 
 
368 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  30.91 
 
 
376 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>