61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1503 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 		 454 aa  890    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.16 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  31.08 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.01 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.97 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  28.87 
 
 		 403 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  30.82 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.37 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.82 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  27 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.01 
 
 		 357 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.93 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.63 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  27.6 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  27.83 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  32.27 
 
 		 351 aa  113  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  31.22 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.5 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.27 
 
 		 352 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  32.17 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.33 
 
 		 356 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  33.6 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.96 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.11 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.54 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  36.78 
 
 		 349 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.87 
 
 		 360 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.13 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  33.18 
 
 		 351 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.78 
 
 		 353 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.14 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  28.52 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  32.74 
 
 		 352 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.85 
 
 		 349 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  32.26 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  32.58 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.58 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  35.12 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  31.25 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  33.67 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  34.76 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.14 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  27.6 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.88 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  29.55 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.1 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.54 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  32.56 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  31.61 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  25.63 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.03 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.71 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  25.1 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.83 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  31.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  27.96 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  29.65 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.64 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  30.61 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  26.25 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>