113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1751 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
399 aa  807    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  40 
 
 
405 aa  308  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  30.94 
 
 
403 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.48 
 
 
389 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  28.28 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.94 
 
 
403 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.83 
 
 
403 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  28.61 
 
 
419 aa  136  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.4 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  33.2 
 
 
351 aa  129  9.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.2 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.2 
 
 
357 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.6 
 
 
454 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
354 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.57 
 
 
360 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  27.53 
 
 
419 aa  123  5e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.39 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  33.21 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.53 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.38 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.1 
 
 
351 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.1 
 
 
352 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.78 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  27.93 
 
 
418 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  34.38 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.3 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  36.61 
 
 
353 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  36.26 
 
 
349 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.96 
 
 
349 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  32.34 
 
 
354 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.41 
 
 
350 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.94 
 
 
356 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.82 
 
 
355 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32 
 
 
358 aa  106  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  32.69 
 
 
349 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  34.3 
 
 
334 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  27.09 
 
 
353 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  24.8 
 
 
459 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
352 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  35.23 
 
 
342 aa  103  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  31.3 
 
 
348 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  34.85 
 
 
338 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  33.67 
 
 
342 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  24.04 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  27.64 
 
 
352 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.17 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  30.32 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.32 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  27.07 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.07 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  29.56 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  35.06 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.43 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.52 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  31.58 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  28.87 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  24.2 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  21.4 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.93 
 
 
360 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.57 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.64 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  23.36 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  25.43 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
364 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  21.76 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.88 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.96 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  23.85 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  23.85 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.84 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  19.92 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0665  3-dehydroquinate synthase  26.37 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  20.07 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.49 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  27.01 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  27.01 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  19.92 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  22.54 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  23.93 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  21.43 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  21.74 
 
 
380 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.22 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  21.76 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1717  3-dehydroquinate synthase  30.19 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  18.87 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  20.41 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  21.67 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  18.87 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0806  3-dehydroquinate synthase  24.75 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.117722  normal  0.388542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  18.87 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  18.87 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  18.87 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  23.44 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  23.44 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  26.52 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  26.52 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  18.87 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  20.43 
 
 
615 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  30 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>