181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5680 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
351 aa  700    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.86 
 
 
355 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.08 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  50.58 
 
 
352 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.53 
 
 
357 aa  338  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  49.01 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  50 
 
 
352 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 
349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.24 
 
 
359 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  30.47 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  32.7 
 
 
351 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.43 
 
 
359 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.23 
 
 
356 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.44 
 
 
351 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  36.47 
 
 
347 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.4 
 
 
359 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.21 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  34.05 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  31.8 
 
 
351 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.85 
 
 
341 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  32.02 
 
 
353 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  32.43 
 
 
342 aa  143  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.84 
 
 
360 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  41.21 
 
 
349 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  31.61 
 
 
342 aa  138  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.36 
 
 
349 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  31.8 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.62 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  34.39 
 
 
342 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.99 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  31.8 
 
 
334 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  30.93 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.03 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.86 
 
 
352 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.37 
 
 
358 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  28.62 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.53 
 
 
350 aa  113  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  30.86 
 
 
353 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.03 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.38 
 
 
405 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.07 
 
 
399 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.3 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.18 
 
 
334 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.44 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  29.29 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  30.26 
 
 
419 aa  87.8  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 
397 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  26.32 
 
 
403 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.22 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.18 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.45 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.83 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  31.71 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  26.21 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  30.28 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  28.88 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.31 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.52 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  27.73 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  27.73 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  25.89 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  28.69 
 
 
459 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  28.06 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.89 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  27.31 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  30.46 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
385 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.96 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  38.38 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  28.98 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.63 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  27.27 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  29.67 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
396 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  24.46 
 
 
359 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  28.93 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  38.54 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  25 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  24.77 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  36.61 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  32.38 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 
368 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.49 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  22.49 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>