209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0604 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  704    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  77.27 
 
 
352 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  74.15 
 
 
350 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  71.02 
 
 
353 aa  498  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  70.17 
 
 
353 aa  484  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  54.39 
 
 
357 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  53.01 
 
 
356 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  49.15 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.3 
 
 
359 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.49 
 
 
354 aa  332  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  49.86 
 
 
359 aa  322  7e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.14 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 
359 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.99 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  44.83 
 
 
351 aa  271  9e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  41.41 
 
 
351 aa  247  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  37.78 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  39.77 
 
 
338 aa  226  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  40.73 
 
 
342 aa  224  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.55 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  44.2 
 
 
341 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 
342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  36.9 
 
 
334 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 
347 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.06 
 
 
334 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  36.62 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  40.86 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.64 
 
 
352 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.15 
 
 
355 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  38.21 
 
 
355 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  39.43 
 
 
349 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.46 
 
 
357 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  35.54 
 
 
352 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.83 
 
 
356 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  31.39 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  32.99 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  38.4 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.05 
 
 
389 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.4 
 
 
349 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  31.25 
 
 
397 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  31.23 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  34.02 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.3 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  32.24 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.69 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  30.73 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.27 
 
 
454 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  29.11 
 
 
418 aa  93.6  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.71 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30 
 
 
403 aa  92.8  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  26.43 
 
 
360 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  30.58 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.82 
 
 
423 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  27.59 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.24 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  29.9 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  26.63 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  26.63 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  27.59 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  29.07 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.4 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  24.14 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  27.72 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  27.33 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  25.48 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.98 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  28.1 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  30.35 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  27.21 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  26.03 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.44 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  25.78 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.22 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  28.86 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  26.09 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  31.4 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  26.09 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>