95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1386 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 321 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  81.31 
 
 		 321 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.66 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  27.76 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  26.57 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  33.48 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.43 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  28.81 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.02 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.9 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  28.38 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.89 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  30.28 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.35 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  30.17 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.12 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.4 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  28.81 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  27.72 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  29.74 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.38 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  26.17 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  27.84 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.27 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.72 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.44 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  24.55 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.77 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  27.15 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  26.61 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.46 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.24 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  28.12 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  29.55 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.06 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  23.57 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  29.54 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.71 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  23.92 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.07 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.6 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  33.83 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  33.83 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.33 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.13 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.06 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.15 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  29.13 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  36.05 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  28.12 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.88 
 
 		 358 aa  52.8  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.1 
 
 		 423 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  28.44 
 
 		 451 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1110  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.77 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  23.64 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  36.46 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  24.6 
 
 		 418 aa  47.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  33.61 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 373 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 384 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  37.78 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  32.73 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  21.95 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  30.43 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  35.29 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  34.83 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  32.43 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  32.43 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1307  3-dehydroquinate synthase  31.07 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0261081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  32.43 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  29.41 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  32.43 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  30.69 
 
 		 459 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  27.23 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0161  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.13 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000741959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 364 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2616  3-dehydroquinate synthase  30.77 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>