More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0161 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0161  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
311 aa  637    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000741959 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1110  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.31 
 
 
314 aa  295  5e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
405 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
368 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1888  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
361 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
383 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.32 
 
 
369 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0048  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
359 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0244255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
382 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
371 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
387 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.63 
 
 
387 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 
359 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
359 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.09 
 
 
410 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
382 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.56 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3279  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 
378 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0689  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  26.97 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2293  propanediol utilization protein PduQ  27.43 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.97 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.08 
 
 
383 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 
387 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.2 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.2 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  25.08 
 
 
383 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 
368 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0507  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.08 
 
 
371 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.85 
 
 
383 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  24.85 
 
 
382 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.85 
 
 
383 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.85 
 
 
382 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5663  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
386 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.77 
 
 
383 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0518  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.63 
 
 
371 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.77 
 
 
382 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4451  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
867 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
373 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
867 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4267  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4115  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4599  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.09 
 
 
386 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.09 
 
 
386 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  26.05 
 
 
370 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
395 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.85 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4104  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2388  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  26.05 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2229  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  26.05 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.73 
 
 
385 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
867 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.68 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2175  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  26.05 
 
 
370 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0389  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 
869 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  26.05 
 
 
370 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.16 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0443  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  24.63 
 
 
858 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.33 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.85 
 
 
395 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
387 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.76 
 
 
387 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
366 aa  89.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.31 
 
 
382 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.4 
 
 
385 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.76 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.78 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.67 
 
 
374 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.29 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003574  alcohol dehydrogenase  25.46 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.76 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.71 
 
 
437 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.84 
 
 
382 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4218  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 
867 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0928  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
364 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02531  hypothetical protein  24.34 
 
 
397 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.76 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  24.52 
 
 
387 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0321  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
878 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 
385 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 
388 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0198  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
370 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1495  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  25.15 
 
 
863 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2411  phosphonate metabolism-associated iron-containing alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
362 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.96 
 
 
386 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3057  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 
373 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0713063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.33 
 
 
382 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  24.33 
 
 
382 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
385 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 
392 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  24.34 
 
 
388 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>