More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0507 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0518  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  97.84 
 
 
371 aa  707    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0507  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
371 aa  744    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0689  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.56 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349918 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0561  alcohol dehydrogenase, iron-dependent  43.32 
 
 
377 aa  323  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000345688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
405 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
388 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
393 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
402 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
389 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
389 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
387 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
378 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
378 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
378 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
378 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
385 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
385 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
382 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
391 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
385 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
385 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
385 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
385 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
382 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
388 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
380 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
388 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
384 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
387 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
387 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
383 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
384 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
397 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 
386 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
392 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.22 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0198  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
370 aa  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.87 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
389 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  28.42 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  28.42 
 
 
395 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  28.42 
 
 
395 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  28.42 
 
 
395 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.87 
 
 
400 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  28.42 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  32.13 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.09 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  32.13 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  32.13 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.09 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  32.13 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  32.13 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  32.13 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1265  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  30.34 
 
 
388 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00856884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
395 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.36 
 
 
400 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.38 
 
 
387 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1465  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  31.03 
 
 
388 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
387 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 
387 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
388 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2388  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  31.74 
 
 
370 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
383 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
388 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
388 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  31.73 
 
 
395 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.93 
 
 
400 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2175  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  31.3 
 
 
370 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
386 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
377 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  31.67 
 
 
370 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
385 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.61 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.33 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2229  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  31.3 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  31.21 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.16 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
872 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
400 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
373 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
368 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  31.36 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>