More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1888 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1888  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
361 aa  723    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0048  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
359 aa  349  5e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0244255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
359 aa  277  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
366 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
371 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  38 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0928  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
387 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 
382 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  35.49 
 
 
394 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
388 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  33.55 
 
 
369 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1060  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
384 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.126321  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
377 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.21 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.21 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
405 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
400 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
383 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.01 
 
 
387 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
380 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
385 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.45 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
395 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.1 
 
 
395 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
387 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
390 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
867 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
380 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
410 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1265  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  33.88 
 
 
388 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00856884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1385  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
389 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
373 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 
387 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
867 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.54 
 
 
384 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.78 
 
 
400 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
867 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4104  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
867 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4115  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
867 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2143  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
365 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
385 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.79 
 
 
887 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
867 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4267  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
867 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4599  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
867 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1709  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
867 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4451  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
867 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1465  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  33.22 
 
 
388 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
382 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
390 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
397 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
383 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
872 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
382 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
384 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
389 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
393 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
375 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
388 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 
399 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.05 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4218  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
867 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
388 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
386 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1561  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
869 aa  139  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000425114  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
394 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
387 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
381 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.58 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
385 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1495  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
863 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.98 
 
 
400 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  34.73 
 
 
382 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
385 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.45 
 
 
402 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
395 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.74 
 
 
386 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
385 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.55 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.65 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  26.35 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>