More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2674 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
371 aa  766    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 
366 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
359 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 
368 aa  275  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0928  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
364 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0048  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
359 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0244255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
377 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1888  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
361 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.74 
 
 
392 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
389 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.32 
 
 
384 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.01 
 
 
387 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
386 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
386 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
383 aa  187  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
395 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.8 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2855  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
865 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
387 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
387 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2540  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
865 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
400 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
382 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.8 
 
 
400 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.8 
 
 
400 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
400 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
382 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1381  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
392 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
385 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.38 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
396 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.21 
 
 
381 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.09 
 
 
382 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
382 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
382 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.3 
 
 
387 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
384 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.77 
 
 
382 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
397 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
386 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
382 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
393 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
395 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.51 
 
 
400 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
382 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  35.06 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  34.63 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4050  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
894 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0532224 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.36 
 
 
400 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.75 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  32.55 
 
 
369 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.18 
 
 
383 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
383 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
390 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
382 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
400 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
402 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
388 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
382 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2322  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
904 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
385 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
395 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
399 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
383 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
403 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1060  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
384 aa  169  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.126321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.29 
 
 
388 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  33.12 
 
 
382 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
358 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0177  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
383 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000105782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1898  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
865 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.715001  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0755  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
872 aa  169  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1983  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
891 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1910  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
872 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358145  unclonable  0.00000423199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
383 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
382 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
385 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
383 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
387 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  35.24 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2165  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
891 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.438641  normal  0.324507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  33.01 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>