More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1315 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  801    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  75.19 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  67.68 
 
 
392 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.38 
 
 
396 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.61 
 
 
395 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.3 
 
 
386 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1381  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.38 
 
 
386 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.55 
 
 
389 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
387 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0784  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.9 
 
 
310 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000947408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
395 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.67 
 
 
388 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
382 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
382 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  38.42 
 
 
382 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
382 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
390 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.47 
 
 
382 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
391 aa  216  4e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
389 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.22 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  37.63 
 
 
382 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
387 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
382 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
382 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
382 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  36.25 
 
 
381 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
382 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.28 
 
 
382 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
387 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 
383 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
387 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 
387 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
383 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
382 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
382 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3240  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
384 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
402 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
382 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 
399 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
382 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_53  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.08 
 
 
380 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0050  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 
380 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000032354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
382 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
383 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
387 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
383 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
382 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.53 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  35 
 
 
383 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
383 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  33.92 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.11 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  38.54 
 
 
395 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
383 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
393 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.88 
 
 
400 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
383 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
383 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
398 aa  192  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
387 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  35.97 
 
 
415 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
383 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  35.97 
 
 
415 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  35.97 
 
 
490 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  33.85 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  33.42 
 
 
390 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
387 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
383 aa  189  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.61 
 
 
400 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
395 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>