More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0050 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  91.32 
 
 		 380 aa  722    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0050  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  783    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000032354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_53  alcohol dehydrogenase, iron-containing  93.42 
 
 		 380 aa  736    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 393 aa  246  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  38.52 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  38.48 
 
 		 395 aa  238  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  36.03 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.89 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.17 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.07 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  36.11 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  34.17 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  34.17 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.41 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.89 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35 
 
 		 391 aa  212  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.89 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.63 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.14 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3240  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  32.88 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.13 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  32.18 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0435  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1645  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.14 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0757662  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  32.11 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  31.91 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  30.48 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  31.43 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  30.92 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0885736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2158  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.11 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  30.64 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.11 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  31.01 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  33.59 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.95 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.95 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  30.03 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  29.89 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>