More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1136 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
359 aa  729    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  65.74 
 
 
359 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  62.67 
 
 
359 aa  478  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  63.61 
 
 
360 aa  473  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  55.68 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.42 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  50.29 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
354 aa  338  7e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 
351 aa  335  7e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.3 
 
 
352 aa  333  3e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  49.57 
 
 
353 aa  322  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 
353 aa  316  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  48.54 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.8 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.25 
 
 
351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  37.86 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 
342 aa  242  7e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  37.9 
 
 
351 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 
342 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 
338 aa  237  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.39 
 
 
358 aa  227  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  37.31 
 
 
347 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  37.1 
 
 
341 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  35.65 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  40.82 
 
 
355 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.76 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.34 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  34.24 
 
 
351 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.64 
 
 
352 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  36.73 
 
 
355 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.13 
 
 
357 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  36.62 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  33.73 
 
 
352 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.92 
 
 
334 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  40.32 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  35.17 
 
 
348 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  30.53 
 
 
403 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  29.11 
 
 
353 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  39.57 
 
 
349 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.61 
 
 
389 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  36.82 
 
 
419 aa  126  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  31.27 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.47 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  31.67 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.17 
 
 
349 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  27.38 
 
 
356 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.33 
 
 
403 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.8 
 
 
405 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.79 
 
 
403 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
366 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  31.19 
 
 
418 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.41 
 
 
423 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3772  3-dehydroquinate synthase  27.36 
 
 
361 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.34 
 
 
451 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1573  3-dehydroquinate synthase  27.04 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1441  3-dehydroquinate synthase  26.73 
 
 
361 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1644  3-dehydroquinate synthase  26.73 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  28.71 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  26.19 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  26.19 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1427  3-dehydroquinate synthase  26.42 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1538  3-dehydroquinate synthase  26.42 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1399  3-dehydroquinate synthase  26.1 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1611  3-dehydroquinate synthase  26.1 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0141651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1680  3-dehydroquinate synthase  26.42 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.80056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1399  3-dehydroquinate synthase  26.1 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  27.12 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.96 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  26.21 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.15 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  28.86 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  27.31 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.97 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  28.62 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  27.86 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.57 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  26.92 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  27.35 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  31.2 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  27.71 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  26.28 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  30.36 
 
 
362 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  24.22 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  26.27 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  30.45 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.61 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  29.88 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  31.75 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>