96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0302 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 		 389 aa  800    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  34.92 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  31.41 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.06 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.93 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.67 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.44 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.81 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.13 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.62 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.41 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.58 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  28.29 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.69 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.35 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  25.71 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  31.43 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.12 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  27.59 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.58 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.13 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  26.45 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.48 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  31.54 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  27.03 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.68 
 
 		 358 aa  124  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  30.21 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  33.58 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  28.83 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  25.78 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  28.79 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  29.63 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  28.09 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  29.6 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.28 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  34.34 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  27.27 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  30.62 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.5 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.2 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  29.46 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  27.72 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  27.91 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.74 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.13 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  31.82 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  24.45 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.25 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.16 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.57 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.94 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.55 
 
 		 334 aa  89.7  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  29.95 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.76 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  24.58 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  23.91 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.67 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  21.49 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.41 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.93 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  25.38 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.83 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.18 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  25.09 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  25.09 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  29.46 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  29.46 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  29.46 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  21.27 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  29.46 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  23.12 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  29.46 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.59 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  25.87 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  22.45 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  21.47 
 
 		 367 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  21.47 
 
 		 367 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  21.47 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  21.47 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.55 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.18 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  22.03 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  22.89 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  22.52 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  21.17 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  22.67 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.78 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>