More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1231 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
347 aa  684    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.38 
 
 
351 aa  242  7e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  43.47 
 
 
360 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  38.78 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  42.15 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  39.31 
 
 
354 aa  231  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  41.23 
 
 
354 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  36.53 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40 
 
 
357 aa  222  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  38.14 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.26 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  37.92 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.8 
 
 
352 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  37.42 
 
 
359 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  42.71 
 
 
353 aa  208  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.19 
 
 
360 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  40.58 
 
 
350 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  39.02 
 
 
353 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  39.45 
 
 
352 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  37.12 
 
 
342 aa  202  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.73 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  36.5 
 
 
342 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  35.17 
 
 
338 aa  192  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  34.74 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.22 
 
 
341 aa  176  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.44 
 
 
334 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  40.47 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  36.75 
 
 
351 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  40.64 
 
 
355 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.44 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.35 
 
 
357 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.68 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.23 
 
 
334 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.39 
 
 
349 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  38.6 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.81 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  36.11 
 
 
352 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  30.03 
 
 
353 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.43 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  37.81 
 
 
349 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  27.89 
 
 
403 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  25.94 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.57 
 
 
389 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.02 
 
 
405 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.63 
 
 
403 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.66 
 
 
403 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.94 
 
 
399 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.54 
 
 
423 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  29.25 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  24.6 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.48 
 
 
454 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  25.17 
 
 
418 aa  90.1  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  28.1 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  27.9 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  27.79 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  27.49 
 
 
369 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  27.54 
 
 
451 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.23 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.04 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  28.13 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  27.73 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  25.98 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  25.98 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  34.94 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  27.03 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  26.57 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  30.14 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  24.74 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  29.04 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.64 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.31 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  28.82 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  26.61 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  26.6 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6533  3-dehydroquinate synthase  26.01 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  hitchhiker  0.00769266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  24.1 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  22.3 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  26.55 
 
 
369 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  33.14 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.53 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  25.72 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>