232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1396 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  746    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  93.19 
 
 		 367 aa  675    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.3 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  35.98 
 
 		 367 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  35.98 
 
 		 367 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  35.98 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  35.98 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  35.69 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  38.49 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  38.49 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  34.56 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  37.92 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  31.2 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  35.35 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  35.03 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  35.03 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  35.03 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  30.36 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  31.39 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  37.5 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  34.87 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  37.5 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  34.87 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  34.54 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  34.54 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  34.54 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  34.54 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  34.54 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  34.54 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  31.04 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  30.88 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  28.65 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  29.56 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  34.16 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  33.85 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  36.96 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  30.54 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  31.09 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  34.81 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  34.81 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  34.81 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  32.82 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  31.58 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  31.02 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  30.81 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  31.16 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  30.05 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  31.76 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  29.25 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  31.76 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  33 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  31.55 
 
 		 371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  31.45 
 
 		 371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  30.28 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  31.45 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  30.49 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  31.23 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  33.33 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  34.34 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  34.66 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  26.86 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  28.36 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  30.89 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  34.83 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  27.76 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  31.27 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1934  hypothetical protein  34.33 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>