87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0940 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  100 
 
 
379 aa  775    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  32.26 
 
 
419 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  37.78 
 
 
419 aa  157  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  33.77 
 
 
418 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  28.45 
 
 
451 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  33.85 
 
 
356 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.86 
 
 
403 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
351 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.42 
 
 
403 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.74 
 
 
389 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.17 
 
 
399 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  35.2 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  31.09 
 
 
397 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  26.15 
 
 
403 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.46 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.08 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  31.02 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  24.63 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.71 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.11 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  25.89 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.89 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  27.83 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.1 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  28.11 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  27.65 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.72 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.16 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  25.95 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.43 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.55 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.98 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  24.91 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  25.36 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.62 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  26.61 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.46 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.42 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.42 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  23.3 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  27.31 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  25.84 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  25.73 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  28.25 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  26.02 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.64 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  25.85 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  25.23 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.35 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.14 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
459 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  23.47 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.11 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.26 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  25.7 
 
 
356 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  22.67 
 
 
364 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
398 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.35 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.33 
 
 
385 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  28.82 
 
 
359 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  23.21 
 
 
366 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  27.06 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.79 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  25.47 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.74 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.49 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  25.7 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.24 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  28.89 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  28.89 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  25.93 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  23.7 
 
 
417 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  23.38 
 
 
363 aa  46.2  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  21.56 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  26.32 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  26.32 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  22.22 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.91 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  26.22 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  24.55 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1240  3-dehydroquinate synthase  24.83 
 
 
369 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
361 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
373 aa  43.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  21.78 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  25.09 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  23.08 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>