269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2346 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  749    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  53.85 
 
 		 365 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  49.3 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  45.15 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  43.8 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  43.61 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  43.73 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  43.61 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  41.85 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  40.77 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  41.13 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  41.13 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  41.13 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  41.13 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.39 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  40.85 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  40.85 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  40.56 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  40.88 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  40.34 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 		 380 aa  262  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  39.39 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  39.39 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  39.11 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  39.11 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  36.84 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  37.97 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  39.78 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  36.89 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  38.2 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  38.2 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  37.92 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  37.92 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  37.64 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  37.58 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  31.74 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  32.88 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  32.01 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 		 373 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  27.75 
 
 		 359 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  26.22 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 		 358 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  28.85 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  28.24 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  24.93 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  28.66 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  26.84 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  28.53 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  27.76 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  30.74 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  30.41 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  31.37 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  25.28 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  31.37 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  31.37 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  27.98 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  27.7 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>