164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_14931 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  97.85 
 
 
372 aa  709    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  761    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  56.98 
 
 
417 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  54.21 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  53.39 
 
 
364 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  54.27 
 
 
366 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  53.65 
 
 
363 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  53.28 
 
 
363 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  53.28 
 
 
363 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
373 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
373 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.29 
 
 
377 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
385 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
396 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
378 aa  285  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  41.87 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
364 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  28.41 
 
 
360 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  29.54 
 
 
360 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
373 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
363 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
380 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  30.19 
 
 
362 aa  149  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  30.43 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  27.57 
 
 
376 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  28.81 
 
 
367 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  32.97 
 
 
364 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  32.97 
 
 
364 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  28.78 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  29.36 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  28.78 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  27.35 
 
 
383 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
368 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  29.14 
 
 
369 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  27.25 
 
 
367 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  27.25 
 
 
367 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  27.25 
 
 
367 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  27.25 
 
 
367 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  26.79 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  26.97 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  28.72 
 
 
369 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  28.72 
 
 
369 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 
379 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.96 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  28.46 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
365 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
383 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
367 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 
359 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  26.1 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  28.53 
 
 
367 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
368 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  29.85 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  27.03 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  28.83 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  27.03 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  27.03 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
364 aa  116  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  25 
 
 
364 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  26.76 
 
 
362 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  26.76 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  26.76 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  26.76 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  27.38 
 
 
362 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.47 
 
 
385 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  29.71 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  30.86 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  29.71 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  29.71 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  28.26 
 
 
362 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  28.26 
 
 
362 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  28.26 
 
 
362 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  30.34 
 
 
361 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  27.2 
 
 
372 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  28.26 
 
 
362 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  28.62 
 
 
362 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  26.91 
 
 
371 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2314  hypothetical protein  30.34 
 
 
361 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0458376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  26.63 
 
 
371 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  26.35 
 
 
371 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  26.63 
 
 
371 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  32.66 
 
 
352 aa  99.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  30.14 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  27.39 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.55 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>