153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0902 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  737    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.17 
 
 		 362 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  41.23 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  40.36 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  35.84 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  34.44 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  32.57 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  34.73 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  34.06 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  32.29 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  34.49 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  33.97 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  30.72 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  30.81 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  30.81 
 
 		 364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  30.81 
 
 		 364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  33.04 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  32.62 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  32.62 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  32.62 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  32.62 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  32.62 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  32.84 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  32.84 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  32.54 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  32.54 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 363 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  32.05 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  30.18 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 		 364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  32.83 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  29.17 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  28.89 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  29.17 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  29.17 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  28.61 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  29 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  29.96 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.07 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  28.62 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  32.02 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  28.95 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  27.86 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  27.86 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  27.86 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  28.81 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  27.05 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  33.97 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  26.69 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  28.3 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  28.19 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  27.8 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  27.92 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  25.45 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.46 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  23.96 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>