146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1052 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
408 aa  838    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  38.61 
 
 
361 aa  249  7e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
361 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  28.88 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  29.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  28.88 
 
 
367 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  27.95 
 
 
367 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  27.95 
 
 
367 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  28.34 
 
 
367 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  28.34 
 
 
367 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  27.95 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  28.34 
 
 
367 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  29.38 
 
 
362 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  29.38 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  29.38 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  25.74 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  29.08 
 
 
362 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  25.34 
 
 
366 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  29.34 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.26 
 
 
366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  28.12 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  30.48 
 
 
398 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
367 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
367 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  30.27 
 
 
371 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
377 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  25.46 
 
 
376 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
374 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
384 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 
396 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  26.56 
 
 
360 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  32.34 
 
 
362 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  27.72 
 
 
364 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 
368 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  32.34 
 
 
362 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  27.72 
 
 
364 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  32.34 
 
 
362 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  30.68 
 
 
372 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  29.51 
 
 
371 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  31.91 
 
 
362 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  31.91 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  25.71 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  25.71 
 
 
369 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  31.91 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  25.71 
 
 
369 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  25.5 
 
 
352 aa  99.8  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  31.49 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  29.91 
 
 
371 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  31.49 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  29.63 
 
 
371 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  31.72 
 
 
362 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  25.71 
 
 
369 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  29.34 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2314  hypothetical protein  30.1 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0458376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  28.71 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  28.96 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  28.96 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  28.96 
 
 
363 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  24.93 
 
 
367 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  26.09 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  27.01 
 
 
379 aa  94  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.36 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
373 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.6 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  27.81 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 
363 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  25.28 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  28.91 
 
 
362 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  24.17 
 
 
365 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.09 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.19 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
339 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
358 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.54 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  29.06 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  25.66 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  29 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  24.59 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  23.75 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>