147 genes were found for organism Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Slin_6827  CDS  NC_013732  144  335  -  192  hypothetical protein  YP_003391575  hitchhiker  0.00000145317  normal  0.0406396  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6828  CDS  NC_013732  681  1019  -  339  hypothetical protein  YP_003391576  hitchhiker  0.000000808462  normal  0.0433999  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6829  CDS  NC_013732  1031  1732  -  702  hypothetical protein  YP_003391577  decreased coverage  0.000000439068  normal  0.0515787  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6830  CDS  NC_013732  1853  2455  +  603  hypothetical protein  YP_003391578  hitchhiker  0.000000745688  normal  0.0705042  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6831  CDS  NC_013732  2620  3045  +  426  hypothetical protein  YP_003391579  hitchhiker  0.00000106313  normal  0.0608228  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6832  CDS  NC_013732  3042  3815  +  774  protein of unknown function DUF955  YP_003391580  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6833  CDS  NC_013732  3844  4299  -  456  hypothetical protein  YP_003391581  hitchhiker  0.00000377078  normal  0.0238538  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6834  CDS  NC_013732  4316  4897  -  582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_003391582  hitchhiker  0.00000544485  normal  0.0136753  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6835  CDS  NC_013732  4904  5053  -  150  hypothetical protein  YP_003391583  hitchhiker  0.000000821502  normal  0.0149745  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6836  CDS  NC_013732  5050  6948  -  1899  hypothetical protein  YP_003391584  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6837  CDS  NC_013732  6965  7189  -  225  hypothetical protein  YP_003391585  hitchhiker  0.00000757443  normal  0.0414929  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6838  CDS  NC_013732  7245  9146  -  1902  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  YP_003391586  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6839  CDS  NC_013732  9204  10403  -  1200  hypothetical protein  YP_003391587  normal  0.0138004  normal  0.108378  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6840  CDS  NC_013732  10472  10996  -  525  hypothetical protein  YP_003391588  normal  0.117042  normal  0.127013  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6841  CDS  NC_013732  11261  11704  -  444  hypothetical protein  YP_003391589  normal  0.144597  normal  0.195365  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6842  CDS  NC_013732  11891  12241  -  351  hypothetical protein  YP_003391590  normal  0.337087  normal  0.234205  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6843  CDS  NC_013732  12300  13190  -  891  domain of unknown function DUF1738  YP_003391591  normal  0.896751  normal  0.17936  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6844  CDS  NC_013732  13485  14567  +  1083  protein of unknown function DUF1016  YP_003391592  normal  1  normal  0.239082  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6845  CDS  NC_013732  14791  15513  +  723  Methyltransferase type 12  YP_003391593  normal  0.613911  normal  0.262077  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6846  CDS  NC_013732  15671  16207  +  537  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  YP_003391594  normal  0.391579  normal  0.145831  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6847  CDS  NC_013732  16236  16430  +  195  hypothetical protein  YP_003391595  normal  0.293998  normal  0.161285  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6848  CDS  NC_013732  16496  17764  +  1269  DNA-directed DNA polymerase  YP_003391596  normal  0.615058  normal  0.214932  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6849  CDS  NC_013732  17799  18626  -  828  hypothetical protein  YP_003391597  normal  0.151599  normal  0.227998  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6850  CDS  NC_013732  19356  20459  +  1104  initiator RepB protein  YP_003391598  normal  0.0436746  normal  0.135729  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6851  CDS  NC_013732  20596  21567  +  972  integrase family protein  YP_003391599  normal  0.100628  normal  0.271303  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6852  CDS  NC_013732  21589  21972  +  384  hypothetical protein  YP_003391600  normal  0.196995  normal  0.393513  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6853  CDS  NC_013732  22009  22590  +  582  hypothetical protein  YP_003391601  normal  0.117929  normal  0.33954  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6854  CDS  NC_013732  22636  23091  +  456  hypothetical protein  YP_003391602  normal  0.150204  normal  0.486603  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6855  CDS  NC_013732  23235  24263  +  1029  hypothetical protein  YP_003391603  normal  0.2188  normal  0.575669  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6856  CDS  NC_013732  24437  24640  +  204  hypothetical protein  YP_003391604  normal  0.570268  normal  0.749092  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6857  CDS  NC_013732  24637  24996  +  360  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_003391605  normal  0.44264  normal  0.767955  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6858  CDS  NC_013732  25102  26151  +  1050  hypothetical protein  YP_003391606  normal  0.809186  normal  0.870097  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6859  CDS  NC_013732  26208  26576  -  369  protein of unknown function DUF326  YP_003391607  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6860  CDS  NC_013732  27395  28471  +  1077  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  YP_003391608  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6861  CDS  NC_013732  28486  29352  +  867  hypothetical protein  YP_003391609  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6862  CDS  NC_013732  29357  30040  +  684  Methyltransferase type 11  YP_003391610  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6863  CDS  NC_013732  30037  30480  +  444  hypothetical protein  YP_003391611  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6864  CDS  NC_013732  30537  31253  +  717  hypothetical protein  YP_003391612  normal  0.747142  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6865  CDS  NC_013732  31260  32039  +  780  hypothetical protein  YP_003391613  normal  0.432634  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6866  CDS  NC_013732  32036  33526  +  1491  Bilirubin oxidase  YP_003391614  normal  1  normal  0.8651  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6867  CDS  NC_013732  33593  34084  +  492  hypothetical protein  YP_003391615  normal  0.345533  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6868  CDS  NC_013732  34111  34704  +  594  transcriptional regulator, AraC family  YP_003391616  normal  0.431853  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6869  CDS  NC_013732  35022  35531  +  510  hypothetical protein  YP_003391617  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6870  CDS  NC_013732  35874  36107  -  234  hypothetical protein  YP_003391618  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6871  CDS  NC_013732  36205  37209  -  1005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_003391619  normal  0.896751  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6872  CDS  NC_013732  38135  38317  -  183  hypothetical protein  YP_003391620  normal  0.986986  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6873  CDS  NC_013732  38511  39101  +  591  Helix-turn-helix, AraC domain protein  YP_003391621  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6874  CDS  NC_013732  39203  39433  +  231  hypothetical protein  YP_003391622  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6875  CDS  NC_013732  39828  40037  +  210  hypothetical protein  YP_003391623  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6876    NC_013732  40154  43511  +  3358      normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6877  CDS  NC_013732  43489  44850  +  1362  Outer membrane protein-like protein  YP_003391624  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6878  CDS  NC_013732  44867  46288  +  1422  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_003391625  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6879  CDS  NC_013732  46291  48114  +  1824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_003391626  normal  0.537519  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6880  CDS  NC_013732  48195  49346  +  1152  hypothetical protein  YP_003391627  normal  0.861416  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6881  CDS  NC_013732  49374  50627  +  1254  hypothetical protein  YP_003391628  normal  0.822628  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6882  CDS  NC_013732  50632  50754  +  123  hypothetical protein  YP_003391629  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6883  CDS  NC_013732  50915  53380  +  2466  TonB-dependent receptor  YP_003391630  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6884  CDS  NC_013732  53408  54202  +  795  transcriptional regulator, AraC family  YP_003391631  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6885  CDS  NC_013732  54270  55511  +  1242  fatty acid hydroxylase  YP_003391632  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6886    NC_013732  55523  56263  -  741      normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6887  CDS  NC_013732  56415  56594  +  180  hypothetical protein  YP_003391633  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6888  CDS  NC_013732  56614  58836  -  2223  copper-translocating P-type ATPase  YP_003391634  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6889  CDS  NC_013732  59233  59835  +  603  transcriptional regulator, AraC family  YP_003391635  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6890  CDS  NC_013732  59926  62190  +  2265  copper-translocating P-type ATPase  YP_003391636  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6891  CDS  NC_013732  62241  62471  +  231  hypothetical protein  YP_003391637  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6892  CDS  NC_013732  62621  63148  +  528  protein of unknown function DUF305  YP_003391638  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6893  CDS  NC_013732  63272  66097  +  2826  multicopper oxidase type 3  YP_003391639  normal  1  normal  0.845063  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6894  CDS  NC_013732  66214  66537  -  324  hypothetical protein  YP_003391640  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6895  CDS  NC_013732  66607  67179  -  573  hypothetical protein  YP_003391641  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6896  CDS  NC_013732  67323  68120  -  798  hypothetical protein  YP_003391642  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6897  CDS  NC_013732  68108  68869  -  762  hypothetical protein  YP_003391643  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6898  CDS  NC_013732  68875  70908  -  2034  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_003391644  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6899  CDS  NC_013732  70968  71540  -  573  hypothetical protein  YP_003391645  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6900  CDS  NC_013732  71643  72299  -  657  hypothetical protein  YP_003391646  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6901  CDS  NC_013732  72886  79707  -  6822  amino acid adenylation domain protein  YP_003391647  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6902  CDS  NC_013732  79714  80259  -  546  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003391648  normal  0.770732  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6903  CDS  NC_013732  80479  81063  -  585  protein of unknown function DUF305  YP_003391649  normal  0.912049  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6904  CDS  NC_013732  81150  81863  -  714  protein of unknown function DUF305  YP_003391650  normal  0.147564  normal  0.887388  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6905  CDS  NC_013732  82028  83284  +  1257  hypothetical protein  YP_003391651  normal  0.10031  normal  0.668757  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6906  CDS  NC_013732  83601  84458  -  858  hypothetical protein  YP_003391652  normal  0.0844727  normal  0.78542  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6907    NC_013732  84540  86135  +  1596      normal  0.252808  normal  0.510316  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6908  CDS  NC_013732  86152  86772  -  621  hypothetical protein  YP_003391653  normal  0.204627  normal  0.59164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6909  CDS  NC_013732  86838  87209  -  372  hypothetical protein  YP_003391654  normal  0.522945  normal  0.660154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6910  CDS  NC_013732  87251  87412  -  162  hypothetical protein  YP_003391655  normal  0.617399  normal  0.8568  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6911  CDS  NC_013732  87471  88121  -  651  hypothetical protein  YP_003391656  normal  0.572875  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6912  CDS  NC_013732  88181  88459  -  279  hypothetical protein  YP_003391657  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6913  CDS  NC_013732  88723  89382  +  660  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  YP_003391658  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6914  CDS  NC_013732  89386  89724  +  339  hypothetical protein  YP_003391659  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6915  CDS  NC_013732  89779  90219  +  441  hypothetical protein  YP_003391660  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6916  CDS  NC_013732  90170  90337  +  168  hypothetical protein  YP_003391661  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6917  CDS  NC_013732  90417  90749  +  333  hypothetical protein  YP_003391662  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6918  CDS  NC_013732  90754  91098  +  345  hypothetical protein  YP_003391663  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6919  CDS  NC_013732  91121  93499  +  2379  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  YP_003391664  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6920  CDS  NC_013732  93512  94660  +  1149  hypothetical protein  YP_003391665  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6921  CDS  NC_013732  94664  95302  +  639  hypothetical protein  YP_003391666  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6922  CDS  NC_013732  95333  96358  +  1026  hypothetical protein  YP_003391667  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6923  CDS  NC_013732  96355  97692  +  1338  hypothetical protein  YP_003391668  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6924  CDS  NC_013732  97689  98903  +  1215  hypothetical protein  YP_003391669  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6925  CDS  NC_013732  98905  99576  +  672  hypothetical protein  YP_003391670  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Slin_6926  CDS  NC_013732  99624  99863  -  240  hypothetical protein  YP_003391671  normal  1  normal  1  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>