19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6836 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1297    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6695  hypothetical protein  35.39 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.16594 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  28.03 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  29.01 
 
 		 918 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  28.19 
 
 		 319 aa  97.8  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  26.21 
 
 		 517 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0822  hypothetical protein  31.69 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.396817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1128  hypothetical protein  31.51 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3682  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.130981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0223  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0750249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3996  hypothetical protein  29.73 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.94 
 
 		 828 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2186  hypothetical protein  30.99 
 
 		 140 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4425  hypothetical protein  26.9 
 
 		 160 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613559 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0143  hypothetical protein  22.22 
 
 		 608 aa  55.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3191  hypothetical protein  28.77 
 
 		 228 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.849991  normal  0.210266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3699  hypothetical protein  28.95 
 
 		 169 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000290761  hitchhiker  0.000000117346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1017  hypothetical protein  27.97 
 
 		 157 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  24.32 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>