27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4644 on replicon NC_013168
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  100 
 
 
517 aa  1073    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  70.63 
 
 
517 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  70 
 
 
918 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  41.31 
 
 
319 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  39.05 
 
 
828 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  28.62 
 
 
632 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6695  hypothetical protein  25.59 
 
 
455 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.16594 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  25.56 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  23.49 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  23.34 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  24.1 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  23.24 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  23.87 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  23.72 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  23.53 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  28.78 
 
 
755 aa  67.4  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  24.04 
 
 
296 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  27.84 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  20.97 
 
 
344 aa  60.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  22.15 
 
 
319 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0143  hypothetical protein  25.79 
 
 
608 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0434  plasmid recombination protein  26.11 
 
 
631 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.7 
 
 
610 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1163  hypothetical protein  27.81 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0870  hypothetical protein  23.81 
 
 
311 aa  45.8  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2740  hypothetical protein  25.53 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  28 
 
 
595 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>