19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3748 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  42.49 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  43.83 
 
 
319 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  41.78 
 
 
343 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  41.88 
 
 
402 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  40.97 
 
 
320 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  40.91 
 
 
322 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  40.98 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  42.53 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  41.58 
 
 
344 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  39.94 
 
 
325 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  41.04 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  32.4 
 
 
828 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  29.65 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  25.16 
 
 
918 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  23.9 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  24.52 
 
 
517 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0107  hypothetical protein  21.2 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  20.73 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>