42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_5006 on replicon NC_008764
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 828 aa  1691    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  41.37 
 
 		 319 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  37.07 
 
 		 918 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  40.19 
 
 		 517 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  39.17 
 
 		 517 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1283  Relaxase/mobilization nuclease family protein  35.29 
 
 		 493 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00213764  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4600  Relaxase/mobilization nuclease family protein  41.46 
 
 		 281 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0452  Relaxase/mobilization nuclease family protein  31.02 
 
 		 457 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220844 
 
 
-
 
NC_010485  EcSMS35_B0002  mobilization protein MbeA  33.2 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011082  SeHA_B0003  mobilization protein MbeA  33.46 
 
 		 524 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009791  EcE24377A_A0003  mobilization protein MobA  32.81 
 
 		 521 aa  110  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3938  hypothetical protein  30.54 
 
 		 419 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255208 
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0005  mobilization protein  27.99 
 
 		 535 aa  100  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1365  mobilization protein  26.6 
 
 		 621 aa  99.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0781  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.43 
 
 		 496 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299304  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  29.31 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  30.66 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  28.12 
 
 		 327 aa  83.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  30.58 
 
 		 325 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  32.4 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  31.72 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2404  hypothetical protein  25.4 
 
 		 348 aa  80.9  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  33.49 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  34.3 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  29.24 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  27.24 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  29.21 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0143  hypothetical protein  24.74 
 
 		 608 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192174  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  30.18 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0032  hypothetical protein  21.52 
 
 		 417 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000480252  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  25.94 
 
 		 632 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  30.63 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.35 
 
 		 1019 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  22.87 
 
 		 341 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1636  hypothetical protein  26.78 
 
 		 196 aa  52  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42824  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5407  hypothetical protein  22.68 
 
 		 341 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0037  relaxase  23.6 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  28.64 
 
 		 755 aa  48.9  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0107  hypothetical protein  27 
 
 		 344 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08174  relaxase NikB  21.01 
 
 		 977 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0873  hypothetical protein  31.97 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6695  hypothetical protein  22.19 
 
 		 455 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.16594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>