19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9158 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  74.69 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  62.5 
 
 		 327 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  62.19 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  61.49 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  63.27 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  60.56 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  61.84 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  57.68 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  57.82 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  51.16 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  40.97 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  34.3 
 
 		 828 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  27.84 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  29.86 
 
 		 918 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  22.84 
 
 		 517 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  24.92 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  20.83 
 
 		 565 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  32.04 
 
 		 627 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>