16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8077 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  814    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  74.69 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  62.81 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  62.42 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  60.53 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  65.89 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  63.55 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  63.05 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  59.39 
 
 		 308 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  54.92 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  50.17 
 
 		 296 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  41.88 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.24 
 
 		 828 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  32.21 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  24.11 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  23.32 
 
 		 918 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>