19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9537 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  62.5 
 
 		 320 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  62.81 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  64.58 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  61.8 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  60.43 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  63.61 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  58.1 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  58.64 
 
 		 308 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  58.02 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  53.2 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  42.49 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.12 
 
 		 828 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  24.23 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  31.65 
 
 		 517 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  22.44 
 
 		 918 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  25 
 
 		 890 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  21.71 
 
 		 565 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  24.66 
 
 		 890 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>