33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1109 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  100 
 
 
755 aa  1556    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  32.19 
 
 
589 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  30.1 
 
 
591 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  31.14 
 
 
341 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5407  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0107  hypothetical protein  30.82 
 
 
344 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  30.69 
 
 
471 aa  97.8  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  27.46 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  30.42 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  29.1 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  28.63 
 
 
514 aa  74.3  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1276  hypothetical protein  26.94 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  31.1 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  26.51 
 
 
307 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  24.91 
 
 
347 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0870  hypothetical protein  24.5 
 
 
311 aa  67.4  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  28.78 
 
 
517 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  26.74 
 
 
310 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  27.93 
 
 
309 aa  65.1  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1163  hypothetical protein  24.93 
 
 
306 aa  64.3  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  28.5 
 
 
517 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  26.6 
 
 
310 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1636  hypothetical protein  30.88 
 
 
196 aa  60.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42824  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  28.04 
 
 
918 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  28.22 
 
 
309 aa  58.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  28.22 
 
 
309 aa  58.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1513  hypothetical protein  25.41 
 
 
477 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  31.29 
 
 
319 aa  56.6  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  25.38 
 
 
313 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  23.26 
 
 
344 aa  54.7  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  21.94 
 
 
334 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2740  hypothetical protein  24.18 
 
 
310 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  28.64 
 
 
828 aa  48.5  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>