35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3003 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  587  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  36.98 
 
 
271 aa  168  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  37.86 
 
 
514 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  35 
 
 
502 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  31.02 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  36.47 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  41.25 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  28.52 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  33.68 
 
 
309 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  37.75 
 
 
307 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  33.01 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  32.33 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  32.04 
 
 
309 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  37.93 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  32.76 
 
 
313 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  31.3 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  30.42 
 
 
755 aa  85.9  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  26.78 
 
 
591 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  30.71 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  31.98 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  27.63 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  32.14 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  28.25 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  28.74 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  32.77 
 
 
555 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  42.37 
 
 
2077 aa  62.4  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1009  hypothetical protein  25.47 
 
 
436 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000000366199  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5635  hypothetical protein  28.07 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272389  normal  0.403881 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5793  hypothetical protein  28.07 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8422799999999998e-21  hitchhiker  8.24928e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  25.74 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  28.21 
 
 
1716 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  25.72 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  27.52 
 
 
2098 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>