38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0299 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  36.6 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  36.67 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  35.44 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  35.09 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  34.83 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  33.57 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  33.57 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  34.7 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  32.61 
 
 		 502 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  32.72 
 
 		 514 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  33.55 
 
 		 344 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  38.85 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  34.62 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  39.08 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  25.9 
 
 		 471 aa  89.4  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  29.76 
 
 		 287 aa  88.6  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  27.37 
 
 		 755 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  32.39 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  26.1 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  24.44 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  31.22 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  29.47 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  27.96 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  29.19 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1009  hypothetical protein  29.05 
 
 		 436 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000000366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  26.94 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  30.81 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  27.89 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  25.37 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  22.81 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  26.43 
 
 		 2077 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  26.84 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  28.27 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5793  hypothetical protein  28.22 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8422799999999998e-21  hitchhiker  8.24928e-21 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5635  hypothetical protein  28.22 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272389  normal  0.403881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>