26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1070 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  516  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  42.23 
 
 
514 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  36.54 
 
 
502 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  38.89 
 
 
268 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  35.96 
 
 
282 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  39.08 
 
 
271 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  37.32 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  32.67 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  34.3 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  31.94 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  35.15 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  31.94 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  30.92 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  31.91 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  29.82 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  31.35 
 
 
344 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  31.33 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  37.18 
 
 
555 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  25.81 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  28.66 
 
 
304 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  35.71 
 
 
2077 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  29.75 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  36.26 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  23.98 
 
 
471 aa  44.7  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  35.29 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  30.7 
 
 
755 aa  42.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>