32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5283 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  40.66 
 
 
514 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  41.6 
 
 
502 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  36.55 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  34.34 
 
 
271 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  29.06 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  30.23 
 
 
310 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  30.1 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  30.62 
 
 
347 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  30.29 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  30.29 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  28.84 
 
 
344 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  41.96 
 
 
268 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  28.15 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  36.41 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  29.6 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  26.51 
 
 
755 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5793  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8422799999999998e-21  hitchhiker  8.24928e-21 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5635  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272389  normal  0.403881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  27.61 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  30 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  25.87 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  25.51 
 
 
589 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  24.79 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  22.83 
 
 
471 aa  55.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  25.4 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  27.68 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  24.19 
 
 
591 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  24.59 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1009  hypothetical protein  30.49 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000000366199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  27.18 
 
 
2077 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  33.65 
 
 
555 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>