22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2970 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  100 
 
 		 313 aa  639    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  57.19 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  56.19 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  55.85 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  54.25 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  53.8 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  29.63 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  34.74 
 
 		 514 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  34.62 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  33.33 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  31.38 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  32.08 
 
 		 268 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  31.07 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  29.15 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  26.06 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  29.92 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  26.62 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  25.38 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  29.07 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  22.58 
 
 		 589 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  22.42 
 
 		 591 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  24.81 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.96837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>