24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  100 
 
 
287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  48.41 
 
 
334 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  61.65 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  43.84 
 
 
344 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00290  hypothetical protein  65.25 
 
 
113 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2341  hypothetical protein  63.08 
 
 
89 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.440373  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  31.3 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  29.76 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  27.07 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  28.84 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  25.3 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  27.37 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  36.45 
 
 
514 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  25.91 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  25.91 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5793  hypothetical protein  31.48 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8422799999999998e-21  hitchhiker  8.24928e-21 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5635  hypothetical protein  31.48 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272389  normal  0.403881 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  30.77 
 
 
591 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  29.91 
 
 
589 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  27.76 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  35.83 
 
 
309 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  35.83 
 
 
309 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  26.6 
 
 
278 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>