18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2265 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  48.28 
 
 
293 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  44.7 
 
 
278 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  45.08 
 
 
304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1569  hypothetical protein  56.25 
 
 
82 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000116147  normal  0.140316 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  28.57 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  32.57 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  31.09 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  27.03 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  24.79 
 
 
307 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  27.49 
 
 
514 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  36.19 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  36.26 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  25.49 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  25.49 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  29.41 
 
 
502 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  28.17 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  24.12 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>